Transcript Information: R_Transcript_12790.p1


Annotated TAIR IDAT2G33170.1
Annotated Gene NameLeucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein
Annotated Gene Symbol(s)
Annotation TypeOrtholog
Chromosome Positionchr2:14056371-14059829 | Reverse length=1124
E-Value0
Link to Arabidopsis eFP Browser 2.0


Transcripts Per Million


Condition 1: 0 Hour
Replicate 110.423184038396
Replicate 26.0613754142978
Replicate 37.3177179832053
Condition 2: 8 Hour
Replicate 17.4676348300648
Replicate 29.9359212525087
Replicate 312.205110127554
Condition 3: 24 Hour
Replicate 19.536319925354
Replicate 28.9618201283884
Replicate 310.042593915165


Fold Change




FASTA Sequences

Nucleotide Sequence

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ATGCCAACTTTGTCAGAATCACAAAAGTTTTGGGGTTTGGGATTTTGGGGGTTTCTCATTGTGAGTGCCTTAGTTATTTGCTCATCTGAGGGGTTGAATTCAGAAGGGCTTTGTCTTTTAGAGCTCAAAAATGGCCTTAATGATAGCTACAATAATCTTGGCAATTGGAATCCTAGTGACCAAACACCCTGTGAATGGAATGGTGTGACTTGTTCCAACAATACTTATCAACCTGTAGTGATAGCTCTTGATCTGAACTCCTTGAACCTTTCGGGATCTATAGGCCCGAGCATTGGCTGTTTAACCCACCTGACTCTTGTTAATCTGTCAAAAAATTCATTGAGTGGGAGAATACCCGACGAGCTTGGTAGTTGCAGCTCCTTGCAGAGTCTTTCTCTTAACAATAATAACTTGGGTGGGTCAATTCCAGCTTCATTGGGTAATTTGTCATTCCTTGAGTATCTTAATATTTGCAACAATGAGCTGTCTGGTTCTATTCCTGAAGAGTTTGGGAACCTTTCGTCGTTGGTTGAATTTGTTGCCTACACTAACAACCTTACTGGTCCTCTGCCTCGATCCTTTTGTCGTCTTAAGCGATTGCAAAGGTTTCGAGCAGGGCAAAATGGGATTAGTGGAAGCTTGCCTGCGGAGATTGGTGAATTGCAATATTTGGAATATCTTGGTCTTGCACAAAATCAGCTTGGTGGGAATATTCCTAAGGAGATTGGGACACTTAGCAGATTGACGGATGTAATTCTTTGGGATAATCAACTTTCAGGCTCGATTCCTAGAGAGATTGGCAACTGTACAAATCTTGTGACTCTTGCTTTGTATGAGAACAATCTTGTTGGGGAAATCCCTGCAGAGATTGGGAATCTCAAGTCTCTTAACTACTTGTACCTCTACAGGAATCACTTGAATGGAACCATCCCAAAGGAGATTGGGAATCTTTCTTTAGCCACACAAGTTGATTTCTCTGAGAACTCTTTGACTGGGGAGATTCCAGTTGAGCTAGCCAACATAAAAGGTCTCACTCTACTCTACCTTTTCGAGAATGGGCTTACCGGTGTTATACCAAATGAGCTCAGTTCTCTAGATAACTTGGTGAAGCTGGATCTTTCGATCAATTATCTCACCGGAACAATTCCGCCAGGATTTCAATACTTAACTCAGATGCTCCAACTGCAGCTCTTTGAGAACTCCCTCACTGGTAGTATCCCTCAAGGGCTTGGGATCTACAGCCGGCTATGGGTGGTTGATTTTTCAGCTAATTCATTGACTGGAAGAATACCTCCATTTCTTTGTCGTCATTCAAACTTAATATTGTTGAATCTCGAGGCCAATAAGCTATATGGAAACATCCCACCTGGGATTCTGGACTGTCCGTCCTTAGTACAGCTTCGTTTGGGTGGGAATCGACTGACAGGTAGTTTTCCTGCAGAACTGTGCAAATTGAAGAACCTATCTGCCGTTGAACTGGGACAGAACAAATTCAGTGGTCCTATCCCACCCGACATTGGCAATTGCAAAAACTTGCAGAGATTAGATATTGCAAGCAATAATTTTGTCTTGGACTTGCCTAAAGAGATTGGCGAGCTGTCTCAGCTGGTGACCTTTAATATCTCTTCGAACTTTTTCAGCGGTCGGATACCAACTGATATTGCAAACTGCAAAAAGCTTCAACGTCTTGATCTTCGCTTCAATGGCTTTGAGGGTGTTCTGCCAGACGAGTTGGGGTCCCTATTGCAGCTGGAGCTTCTCATGCTTTCGGAAAACAAGTTTTCTGGGAACATGCCAGACGCATTGGGGAATCTGTCTCGCTTGACAGAGCTCCAGATGGGTGGGAACTTCTTTTCAGGGCCAATACCAGCGTCACTAGGATCACTTTCGAGCTTGCAGATTGCTATGAACCTTAGCAGTAATAATATTTCTGGGAACATACCGTCGGCGCTTGGGAATCTGAACCTCCTGGAGTATCTTTATCTCAATAATAACCACTTGAGTGGAGAAATTCCGAGCACATTTGGGAATCTTTCGAGCTTGCTTGGTGTAAACTTCTCGTTCAATGATCTAACAGGCCCTATACCTTCAATACCATTATTCCAGACTATGGCAGTCAGCAGCTTTGTTGGAAACAAAGGTCTCTGTGGTCAGCCTCTTAGTGCTTGCAGTGATGCTTCATTGTCTAATGCCGTTCCACCGCCAAAAAATGCTGAATCCCCTCGTGGAAAAATGATTACTGTAGCTGCAGCCATCGTTGGAGGCGTTTCACTCATTCTTATCGTTGTGATACTGTTCCACATGCGAAGACCTGTGGAAACAGTGGCTTCTGTGGAAGAGAATGATGATTCCTCTGTTTCGGATATTTACTTCCCTCCCAAGGAAGGGTTCACTTTCCAAGATCTGGTCGAGGCAACAAACAATTTTCATGAGAGTTATGTCATTGGAAGTGGTGCTTGCGGGACGGTTTACAAAGCAGTGATGCGTACAGGACTGACAATTGCTGTTAAGAGATTAGCTTCTAACAGGGAAGGTAACAACATTGAGAACAGCTTCCGTGCTGAGATTTTGACCCTTGGAAAGATTAGACATCGGAATATTGTGAAGCTTTATGGGTTTTGCTATCACCAGGGTTCTAATTTACTGCTTTACGAGTACATGGCAAGAGGTAGCTTGGGTGAGCTGCTCCATGGCTCGTCATGTAGCTTAGATTGGCCCACCAGGTTCTTGATTGCACTTGGTGCAGCTCAAGGTCTTGCATATTTGCACCATGACTGCAAACCGAGGATCATTCACCGTGATATAAAGTCCAATAATATCCTGCTCGATGAGAAGTTCGAAGCACATGTTGGTGATTTTGGCTTGGCGAAGGTTGTTGACATGCCTCAGTCAAAGTCAGTGTCTGCAGTTGCTGGTTCATATGGATATATCGCTCCTGAATATGCTTACACCATGAAGATTACAGAGAAGTGTGATATCTATAGCTATGGAGTAGTTCTTTTGGAGTTGCTAACCGGAAGAACCCCTGTACAGCCCTTAGATCAGGGAGGCGATCTTGTTAATTGGGTGAAAACTTATATTCGGAACAATTCAATAACACCCGGGATACTTGACTCTCGATTAAATCTACAAAGAGCGATTGTTGATCACATGCTAACCGTCATGAAACTTGCTTTAGTATGCACTAGCATGTCCCCTACCGATCGGCCATCAATGCGGCAAGTTGTGTCGATATTGATTGAGTCAGATGAGCCTGAAGGGAAGTTGGATTCCCCTTCGTTTCATGATATACCTCTGAGAGATAATGCAGTCTGA

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Protein Sequence

>R_Transcript_12790.p1 GENE.R_Transcript_12790~~R_Transcript_12790.p1 ORF type:complete len:1105 (+),score=199.24,Pkinase|PF00069.21|7.2e-49,Pkinase_Tyr|PF07714.13|4.4e-44,LRR_8|PF13855.2|0.023,LRR_8|PF13855.2|6.9e-05,LRR_8|PF13855.2|0.0022,LRR_8|PF13855.2|5.8,LRR_8|PF13855.2|8.1e-05,LRR_8|PF13855.2|5.3,LRR_8|PF13855.2|0.0022,LRR_8|PF13855.2|0.022,LRR_8|PF13855.2|0.0014,LRR_8|PF13855.2|2.1e-05,LRR_8|PF13855.2|4.7e-06,LRR_8|PF13855.2|0.0081,LRR_8|PF13855.2|85,LRR_4|PF12799.3|59,LRR_4|PF12799.3|0.59,LRR_4|PF12799.3|0.051,LRR_4|PF12799.3|2.1e+02,LRR_4|PF12799.3|0.0037,LRR_4|PF12799.3|0.014,LRR_4|PF12799.3|0.12,LRR_4|PF12799.3|2.1e+03,LRR_4|PF12799.3|0.55,LRR_4|PF12799.3|0.12,LRR_4|PF12799.3|0.03,LRR_4|PF12799.3|1.9,LRR_4|PF12799.3|6.9,LRR_4|PF12799.3|2.1,LRRNT_2|PF08263.8|7.7e-12 R_Transcript_12790:215-3529(+)
MPTLSESQKFWGLGFWGFLIVSALVICSSEGLNSEGLCLLELKNGLNDSYNNLGNWNPSDQTPCEWNGVTCSNNTYQPVVIALDLNSLNLSGSIGPSIGCLTHLTLVNLSKNSLSGRIPDELGSCSSLQSLSLNNNNLGGSIPASLGNLSFLEYLNICNNELSGSIPEEFGNLSSLVEFVAYTNNLTGPLPRSFCRLKRLQRFRAGQNGISGSLPAEIGELQYLEYLGLAQNQLGGNIPKEIGTLSRLTDVILWDNQLSGSIPREIGNCTNLVTLALYENNLVGEIPAEIGNLKSLNYLYLYRNHLNGTIPKEIGNLSLATQVDFSENSLTGEIPVELANIKGLTLLYLFENGLTGVIPNELSSLDNLVKLDLSINYLTGTIPPGFQYLTQMLQLQLFENSLTGSIPQGLGIYSRLWVVDFSANSLTGRIPPFLCRHSNLILLNLEANKLYGNIPPGILDCPSLVQLRLGGNRLTGSFPAELCKLKNLSAVELGQNKFSGPIPPDIGNCKNLQRLDIASNNFVLDLPKEIGELSQLVTFNISSNFFSGRIPTDIANCKKLQRLDLRFNGFEGVLPDELGSLLQLELLMLSENKFSGNMPDALGNLSRLTELQMGGNFFSGPIPASLGSLSSLQIAMNLSSNNISGNIPSALGNLNLLEYLYLNNNHLSGEIPSTFGNLSSLLGVNFSFNDLTGPIPSIPLFQTMAVSSFVGNKGLCGQPLSACSDASLSNAVPPPKNAESPRGKMITVAAAIVGGVSLILIVVILFHMRRPVETVASVEENDDSSVSDIYFPPKEGFTFQDLVEATNNFHESYVIGSGACGTVYKAVMRTGLTIAVKRLASNREGNNIENSFRAEILTLGKIRHRNIVKLYGFCYHQGSNLLLYEYMARGSLGELLHGSSCSLDWPTRFLIALGAAQGLAYLHHDCKPRIIHRDIKSNNILLDEKFEAHVGDFGLAKVVDMPQSKSVSAVAGSYGYIAPEYAYTMKITEKCDIYSYGVVLLELLTGRTPVQPLDQGGDLVNWVKTYIRNNSITPGILDSRLNLQRAIVDHMLTVMKLALVCTSMSPTDRPSMRQVVSILIESDEPEGKLDSPSFHDIPLRDNAV*

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