Transcript Information: S_Transcript_217878.p1


Annotated TAIR IDAT3G14730.1
Annotated Gene NamePentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
Annotated Gene Symbol(s)
Annotation TypeOrtholog
Chromosome Positionchr3:4949385-4951346 | Reverse length=653
E-Value2.6E-214
Link to Arabidopsis eFP Browser 2.0


Transcripts Per Million


Condition 1: 0 Hour
Replicate 11.0845423700857
Replicate 20.76078584681086
Replicate 30.92502751516492
Condition 2: 8 Hour
Replicate 12.03894797703
Replicate 22.0338044217933
Replicate 32.1048564249433
Condition 3: 24 Hour
Replicate 10.99294924957246
Replicate 20.81703395964889
Replicate 30.79065969921994


Fold Change




FASTA Sequences

Nucleotide Sequence

>S_Transcript_217878.p1 GENE.S_Transcript_217878~~S_Transcript_217878.p1 ORF type:complete len:638 (+),score=95.49,PPR_2|PF13041.2|1,PPR_2|PF13041.2|31,PPR_2|PF13041.2|9.2e-12,PPR_2|PF13041.2|0.87,PPR_2|PF13041.2|1.6e-10,PPR_2|PF13041.2|0.79,PPR_2|PF13041.2|1.4e-05,PPR_2|PF13041.2|0.12,PPR_2|PF13041.2|6.7e-09,PPR_2|PF13041.2|0.72,PPR|PF01535.16|4e+03,PPR|PF01535.16|0.12,PPR|PF01535.16|0.00017,PPR|PF01535.16|0.0077,PPR|PF01535.16|9.4e-06,PPR|PF01535.16|0.013,PPR|PF01535.16|0.14,PPR|PF01535.16|22,PPR|PF01535.16|0.039,PPR|PF01535.16|6.1e-07,PPR|PF01535.16|4.4,PPR|PF01535.16|0.017,PPR|PF01535.16|33,PPR|PF01535.16|1.3e+04,PPR_3|PF13812.2|1.3e+04,PPR_3|PF13812.2|3.7e+02,PPR_3|PF13812.2|7.1,PPR_3|PF13812.2|33,PPR_3|PF13812.2|0.036,PPR_3|PF13812.2|1.6e+04,PPR_3|PF13812.2|1.7,PPR_3|PF13812.2|2.4e+02,PPR_3|PF13812.2|25,PPR_3|PF13812.2|2.3,PPR_3|PF13812.2|0.63,PPR_3|PF13812.2|4.6e+03,PPR_1|PF12854.3|42,PPR_1|PF12854.3|0.35,PPR_1|PF12854.3|3.5e+02,PPR_1|PF12854.3|0.31,PPR_1|PF12854.3|0.001,PPR_1|PF12854.3|14,PPR_1|PF12854.3|1.3e+03,PPR_1|PF12854.3|9.4e+03,PPR_1|PF12854.3|2.4e+02,PPR_1|PF12854.3|1.8e+03,PPR_1|PF12854.3|1.7e+02,PPR_1|PF12854.3|0.024,PPR_1|PF12854.3|18,PPR_1|PF12854.3|0.0049,PPR_1|PF12854.3|2e+03 S_Transcript_217878:219-2132(+)
ATGCTTAATGGAAAAGGATTCATGTTTGCCTCATCTCTCATTAGATATTCAAAACACCCGTTTCTTTTACTCAGGTTAGCCTCAATTTCCTCTCTCCAACATTTCCAACAAGACATCCATAAAACCATCCCTAAGTGCATATCCCTTCTACAATCCTTTGCTCAACAATCCAATCTTTCCAATGGCAAAGAACTCCATTCTTGGATGCTAAGAAACAACCTTTTAAGTTCCCCTTTATCCATTACAAGCCTCATTAACATGTATTCTAAGTGCAATAACATGTCCTACGCCTTGTCAGTCTTCGAAAATTCCGAAAATATTCGTAATGTTTATGCTTACAATGCAATAATTTCTGGGTTTGTTGCTAATAACTTGTATGATGAAGGGTTTAAGTTATATTTGCATATGCGGTGTCATGGTGTTCCACCAGATAAATTCACTTTTCCTTGTGCAATCAAGGGTTGTTCAGATATTTTAGAGGTTAAAAAGATTAATGGGTTGTTGTTTAAATTTGGGTTGGAGTTGGATTTATTTGTTGGGAGCGCTTTGGTTAATTGTTACTTGAAATTTGGGTGTGTGGATGATGCCTACCAACTGTTCGACGAATTGCCTGTTAGAGATGTTGTGCTTTGGAATGCTATGATTAATGGGTATATGCATATTGGGGAATTTGGAATGGCCTTGGAGGTGTTTAAGAGGATGAGTAATTGTATGGTTGTACCAAATAACTTCACAACTACAGGGGTTTTATCAGCTTTGTCTATGAGTGCAGACCTTGATAATGGACGTGCGATTCACGGTTTTGTGATAAAAAGAGGTTATGATTCCGTTGTTGCTGTCTCAAATGCGTTGATTGATATGTACGGAAATTGCAAATGCATTGATGAGGCTGTCAGGATCTTTGAGTTGATATCGGAAAAGGACATATTCTCGTGGAATACAGTGATAGGCGTCAATGAACAAACTGGTGATCATCAGGTTACGATAGAATTTTTTCGTAGGATGTTAGATTCAGGGGTTAGACCTGATTTTGTTACAGTAACTACAGTCCTTCCGGCATGCTCTCATTTGGGAGCGTTGATGCATGTTAAGGAGATCCATAAGTACATGATTGTTAATGGGTTGGGGAGCAGTGGAGACATGAAAGATTTTGATGGTTTGGTTGTGAACAATACTCTTATGGATATTTATGTCAAATGTGGTAGTATGAAGTATGCATACATGATTTTCCAAAATATGAGTTTAAGAGATGTGGCATCATGGAATATCATGATCATGGGATATGGCATGCATGGTCTTGGCGAAAAGGCCCTATCTATGTTTGATTGTATGTGCAATCAACAGATCAAGCCTGATGAGGTCACCTTTGTAGGTGTTCTGTCAGCCTGTAGTCATGCAGGCCTTGTGAGTCGGGGCCGTGAGTACCTGTCGCAAATGGATTCTCTCTATGGTTTGGTTCCGGCTATTGAACATTATGTCTGTGTGATTGACATGCTTGGTAGAGCTGGGCAGCTTGATGAGGCTTATGAATTATTGCTCACAATGCCTATTGAGAGTAATGCTGTGGCATGGAGGGCTTTCTTAGCAGCATGTAGGCTTCATGGAAATGCATATCTTGCTGAGATTGCTTCTAAGCACATATTTGAGCTTGAGCCTGAACATTGTGGAAATTATGTATTGATGTCTAATGTTTATGGAGCAACTGGTCGTTATGAAGAGGTTTCAGATGTAAGAGTCACAATGAAGGGGCACAACATAAAAAAGAAACCTGGTCATAGTTGGATCGAAATCAATAATGGTGTGCATGCTTTCAGCACTGGTGATCGGGACCATCCTGAAGCCAACTTAATCTATGCCAGTCTTGATTCTCTGATTGCTTCTGTTTGTGAACATGGTTATATGCTGTCTGTATAG

Click here to download the sequence:
Link to NCBI Nucleotide BLAST

Protein Sequence

>S_Transcript_217878.p1 GENE.S_Transcript_217878~~S_Transcript_217878.p1 ORF type:complete len:638 (+),score=95.49,PPR_2|PF13041.2|1,PPR_2|PF13041.2|31,PPR_2|PF13041.2|9.2e-12,PPR_2|PF13041.2|0.87,PPR_2|PF13041.2|1.6e-10,PPR_2|PF13041.2|0.79,PPR_2|PF13041.2|1.4e-05,PPR_2|PF13041.2|0.12,PPR_2|PF13041.2|6.7e-09,PPR_2|PF13041.2|0.72,PPR|PF01535.16|4e+03,PPR|PF01535.16|0.12,PPR|PF01535.16|0.00017,PPR|PF01535.16|0.0077,PPR|PF01535.16|9.4e-06,PPR|PF01535.16|0.013,PPR|PF01535.16|0.14,PPR|PF01535.16|22,PPR|PF01535.16|0.039,PPR|PF01535.16|6.1e-07,PPR|PF01535.16|4.4,PPR|PF01535.16|0.017,PPR|PF01535.16|33,PPR|PF01535.16|1.3e+04,PPR_3|PF13812.2|1.3e+04,PPR_3|PF13812.2|3.7e+02,PPR_3|PF13812.2|7.1,PPR_3|PF13812.2|33,PPR_3|PF13812.2|0.036,PPR_3|PF13812.2|1.6e+04,PPR_3|PF13812.2|1.7,PPR_3|PF13812.2|2.4e+02,PPR_3|PF13812.2|25,PPR_3|PF13812.2|2.3,PPR_3|PF13812.2|0.63,PPR_3|PF13812.2|4.6e+03,PPR_1|PF12854.3|42,PPR_1|PF12854.3|0.35,PPR_1|PF12854.3|3.5e+02,PPR_1|PF12854.3|0.31,PPR_1|PF12854.3|0.001,PPR_1|PF12854.3|14,PPR_1|PF12854.3|1.3e+03,PPR_1|PF12854.3|9.4e+03,PPR_1|PF12854.3|2.4e+02,PPR_1|PF12854.3|1.8e+03,PPR_1|PF12854.3|1.7e+02,PPR_1|PF12854.3|0.024,PPR_1|PF12854.3|18,PPR_1|PF12854.3|0.0049,PPR_1|PF12854.3|2e+03 S_Transcript_217878:219-2132(+)
MLNGKGFMFASSLIRYSKHPFLLLRLASISSLQHFQQDIHKTIPKCISLLQSFAQQSNLSNGKELHSWMLRNNLLSSPLSITSLINMYSKCNNMSYALSVFENSENIRNVYAYNAIISGFVANNLYDEGFKLYLHMRCHGVPPDKFTFPCAIKGCSDILEVKKINGLLFKFGLELDLFVGSALVNCYLKFGCVDDAYQLFDELPVRDVVLWNAMINGYMHIGEFGMALEVFKRMSNCMVVPNNFTTTGVLSALSMSADLDNGRAIHGFVIKRGYDSVVAVSNALIDMYGNCKCIDEAVRIFELISEKDIFSWNTVIGVNEQTGDHQVTIEFFRRMLDSGVRPDFVTVTTVLPACSHLGALMHVKEIHKYMIVNGLGSSGDMKDFDGLVVNNTLMDIYVKCGSMKYAYMIFQNMSLRDVASWNIMIMGYGMHGLGEKALSMFDCMCNQQIKPDEVTFVGVLSACSHAGLVSRGREYLSQMDSLYGLVPAIEHYVCVIDMLGRAGQLDEAYELLLTMPIESNAVAWRAFLAACRLHGNAYLAEIASKHIFELEPEHCGNYVLMSNVYGATGRYEEVSDVRVTMKGHNIKKKPGHSWIEINNGVHAFSTGDRDHPEANLIYASLDSLIASVCEHGYMLSV*

Click here to download the sequence:
Link to NCBI Protein BLAST