Transcript Information: S_Transcript_84314.p1


Annotated TAIR IDATCG01010.1
Annotated Gene NameNADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein
Annotated Gene Symbol(s)NDHF
Annotation TypeOrtholog
Chromosome PositionchrC:110398-112638 | Reverse length=746
E-Value0
Link to Arabidopsis eFP Browser 2.0


Transcripts Per Million


Condition 1: 0 Hour
Replicate 112.843975195054
Replicate 22.8020922566362
Replicate 36.2626403278537
Condition 2: 8 Hour
Replicate 14.9892290180458
Replicate 25.9817777111568
Replicate 39.8315072509606
Condition 3: 24 Hour
Replicate 13.1248696971839
Replicate 23.6662048138209
Replicate 37.8903187042743


Fold Change




FASTA Sequences

Nucleotide Sequence

>S_Transcript_84314.p1 GENE.S_Transcript_84314~~S_Transcript_84314.p1 ORF type:complete len:748 (+),score=-47.54,Proton_antipo_C|PF01010.15|5.1e+03,Proton_antipo_C|PF01010.15|6.5e+03,Proton_antipo_C|PF01010.15|8.2e-114,Proton_antipo_M|PF00361.16|3.2,Proton_antipo_M|PF00361.16|2.4e+03,Proton_antipo_M|PF00361.16|7.6e-100,Proton_antipo_M|PF00361.16|3e+03,Proton_antipo_N|PF00662.16|4.3e-19 S_Transcript_84314:896-3139(+)
ATGGAACATATATACCAATATGCATGGATCATACCCTTCATTCCACTTACAGTTCCTTTGTTAATAGGAGTGGGACTTCTTCTTTTCCCGACGGCAACAAAAAATCTTCGGCGTATATGGGCTTTTTCGAGTATTGCGTTGTTAAGTATAGTTATGATTTTTTCTATGAAGTTGTCTATTCAGCAAATAAATAGTAATTTGATTTATCAATATGTATGGTCGTGGACCATTAATAATGATTTTTCTTTAGAATTCGGCTACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGTTAATGTTAATCACTACTGTTGCAATTCTCGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGTCTCATGATCAAGGATATTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAATATTTCAATGTTAGGATTAGTTACTAGTTCAAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTAGTTGGAATGTGTTCATATTTATTAATAGGTTTTTGGTTCACACGACCTATTGCTGCAAATGCTTGTCAAAAAGCGTTTGTGACTAATCGTATAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGACTTTATTGGATAACAGGCAGTTTCGAATTTGGGGATTTGTTTGAAATATCTAATAATTTAATTAAGAATAATGAGATCCATTTTTTGTTTTGTATTTTATGTACTTTCTTATTATTTGCCGGGGCAATTGCTAAATCTGCTCAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGGCCTACTCCTATTTCAGCTCTCATACATGCAGCTACCATGGTAGCTGCGGGGATTTTTCTAGTCGCTCGACTTCTTCCTCTTTTTATAGTTATACCTTACATTATGAATGTAATATCTATTATAGGAATAATAACAGTACTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTAAGAGAAGTTTAGCTTATTCTACAATGTCTCAATTGGGCTATATGATGTTAGCTCTAGGTATGGGTTCTTATCGAGCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCAAAAGCATTATTGTTTTTAGGCTCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAAGCTATTGTTGGATATTCTCCAGATAAAAGTCAAAATATGGTTCTTATGGGAGGGTTAACAAGACATGTACCAATTACAAAAACTTCTTTTTTAATTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCGCCGATTTTCGCAATAATAGCTTATTTTACAGCCGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGAATTTATTTACTTACTTTTGAAGGTCATTTAAACATTTATTTTAAAAATTATAGTGGACAAAAAAGTCCTTCTTTCTATTCAATATCACTATGGGGGAAAGAAGGACTGCAAAAGATTAATAAAAATTTTGGGTTATTAAACTTATTAGTAATGAATAATAGGGAAAGGGCTTCTTTTTTTTCAAAAAACAAAAAACCACATCAAAAAAAAATGGGTGGAAATATAAAAAAAATGATGCAATCCTTTATTAGTATTACTGATTTTGACAATAAGAATATTTCGTCATATCCTCATGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCTCTGATTGTATTAATTCTGTTTACTTTTTTTATTGGATTTATAGGAATTCCTTTCAATCAAGAAGAAATGAATTTAGATATATTAACTAAATGGTTAACTCCATCCATAAATCTTTTACATTCAAATTCGAATAATTCTCTGGATTGGTATGAATTTGTGATAAATGCAACTTTTTCCGTTAGTATAGCTTATTTTGGAATATTTATAGCTTTCTTTTTATATAAACCGATTTATTCATCATTAAAAAATTTTTACTTAATAAATTCATTTGATAAAAGAGGTTCAAAGAGAATTCTTTGGGACAAAATTATCAATATTATATATAATTGGTCTTCTAACCGCGGTTATATAGATACTTTTTATGCAACAGCTTTAATTAGGGGTGTAAGAGGCTTGGTCGAAGTAGTTTCTTTTTTTGATAGACGAATAATTGATGGAATTCCGAATGGTTTTGGTGTTACAAGTTTTTTTGTAGGAGAAGGTATCAAATATATAGGGGGGGGTCGCATTTCCTCGTATCTTTTTTTGTATTTATTCTATGTATCAATTTTTTTATTAATTTACTATTTCGTTTCTTAA

Click here to download the sequence:
Link to NCBI Nucleotide BLAST

Protein Sequence

>S_Transcript_84314.p1 GENE.S_Transcript_84314~~S_Transcript_84314.p1 ORF type:complete len:748 (+),score=-47.54,Proton_antipo_C|PF01010.15|5.1e+03,Proton_antipo_C|PF01010.15|6.5e+03,Proton_antipo_C|PF01010.15|8.2e-114,Proton_antipo_M|PF00361.16|3.2,Proton_antipo_M|PF00361.16|2.4e+03,Proton_antipo_M|PF00361.16|7.6e-100,Proton_antipo_M|PF00361.16|3e+03,Proton_antipo_N|PF00662.16|4.3e-19 S_Transcript_84314:896-3139(+)
MEHIYQYAWIIPFIPLTVPLLIGVGLLLFPTATKNLRRIWAFSSIALLSIVMIFSMKLSIQQINSNLIYQYVWSWTINNDFSLEFGYLIDPLTSIMLMLITTVAILVLIYSDNYMSHDQGYLRFFAYMSFFNISMLGLVTSSNLIQIYIFWELVGMCSYLLIGFWFTRPIAANACQKAFVTNRIGDFGLLLGILGLYWITGSFEFGDLFEISNNLIKNNEIHFLFCILCTFLLFAGAIAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNVISIIGIITVLLGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGMGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSVIHSMEAIVGYSPDKSQNMVLMGGLTRHVPITKTSFLIGTLSLCGIPPLACFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIAYFTAGLTAFYMFRIYLLTFEGHLNIYFKNYSGQKSPSFYSISLWGKEGLQKINKNFGLLNLLVMNNRERASFFSKNKKPHQKKMGGNIKKMMQSFISITDFDNKNISSYPHESDNTMLFPLIVLILFTFFIGFIGIPFNQEEMNLDILTKWLTPSINLLHSNSNNSLDWYEFVINATFSVSIAYFGIFIAFFLYKPIYSSLKNFYLINSFDKRGSKRILWDKIINIIYNWSSNRGYIDTFYATALIRGVRGLVEVVSFFDRRIIDGIPNGFGVTSFFVGEGIKYIGGGRISSYLFLYLFYVSIFLLIYYFVS*

Click here to download the sequence:
Link to NCBI Protein BLAST